如何把两个bash命令在CWL文件中?
我是CWL工具的新手。 我可以在basecommand中使用任何bash命令,即:
basecommand cat
要么
basecommand [wc, -w]
我应该如何修改它以使其与
cat | wc -w
会做?
应该使用参数和InlineJavascriptRequirement来指定参数的input:
baseCommand: cat arguments: - $(inputs.infile) - "|" - wc - w